Krajem 2007. započet je preustroj kojim se sustav izobrazbe ponovno organizira i provodi u jedinstvenoj ustanovi HVU “Petar Zrinski”, ali s novom, manjom i racionalnijom organizacijskom strukturom. Glavno je obilježje izrada novih programa, nastavak provedbe izobrazbe kadeta, integracija i razvoj sustava civilno – vojnog školovanja, intenziviranje modernizacije učioničkih i smještajnih kapaciteta, primjena novih nastavnih metoda i provedba specijalističkog dijela izobrazbe u suradnji s obučnim postrojbama i središtima za obuku HKoV-a i Središtima za obuku HRM-a, HRZ i PZO-a i Zapovjedništva za potporu. Usvajanjem Koncepta Izobrazbe za potrebe Oružanih Snaga RH 2007. godine, izvršena je prilagodba sustava školovanja na HVU-u i od tada se svi programi izvode u skladu sa zahtjevima koji su definirani tim dokumentom.

Do 2014. godine završen je postupak akreditacije novih sveučilišnih studijskih programa za potrebe MORH i OSRH – Vojno vođenje i upravljanje i Vojno inženjerstvo, čija provedba je započela u akademskoj godini 2014./2015. Navedeni studijski programi upisani su u Upisnik studijskih programa pri  Ministarstvu znanosti, obrazovanja i sporta.. Također, osnovan je Centar za obrambene i strateške studije kao referentno mjesto za vojne i strateške analize. Ustrojstvenim promjenama Škola stranih jezika postaje Središte za strane jezike “Katarina Zrinska”.

2015. godine HVU postaje Hrvatsko vojno učilište “Dr. Franjo Tuđman”, a osnovan je i Centar vojnih škola “Petar Zrinski”. Centar za obrambene i strateške studije je imenovan po generalu Janku Bobetku, Časnička škola po generalu Andriji Matijašu Pauku, a Dočasnička škola po pukovniku Damiru Tomljanoviću Gavranu.

Objava 25. godina Hrvatskog vojnog učilišta pojavila se prvi puta na MORH.